Veteriner Kontrol Merkez Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü (VKMAEM) Kalite Yönetim Sistemini, TS EN ISO/IEC 17025 “Deney ve Kalibrasyon Laboratuvarlarının Yetkinliği için Genel Gereklilikler" standardındaki şartları sağlayarak, müşterinin ve yasal otoritelerin veya kuruluşların ihtiyaçlarına cevap verecek şekilde kurmuştur.
VKMAE 2003 ve 2004 yıllarında akreditasyon çalışmalarına başlamış olup, birçok test metodu Eylül 2005 itibari ile TS ISO EN 17025 kalite sistemine uygunluk açısından TÜRKAK tarafından akredite edilmiştir. Kendi alanında Türkiye'de ilk akredite olan kuruluştur. Kalite Yönetim Birimi Enstitü Müdürlüğü'nün TS EN ISO/IEC 17025 standardına göre oluşturulan kalite politikası ve kalite hedefleri doğrultusunda çalışır, çalışılmasını sağlar. Bu bağlamda, Kalite Yönetim Birimi Kalite Yönetim Sistemi çerçevesinde belirlenen uygulamaların hangi genel prensiplere, usul ve esaslara göre yürütüleceğinin ortaya konulduğu prosedürler ve uygulama ile ilgili yetki ve sorumluluklar belirleyerek uygulama detayları için ilgili dokümanlar (talimatlar, formlar, listeler vb.) oluşturmuştur. Kalite Yönetim Sistemi gereği tüm personelin Enstitü kalite politikasını, prosedürleri, talimatları ve destek dokümanları bilmesi, anlaması ve uygulaması zorunludur. Kalite Yönetim Birimi bu standardın uygulanmasını ve takibini sağlamaktan ve Yönetim Sisteminin performansını değerlendirerek performans raporu sunmaktan sorumludur.