Pendik Veteriner Kontrol Enstitüsü İlaç Kalite Kontrol Laboratuvarı, Gıda Tarım ve Hayvancılık Bakanlığı Gıda ve Kontrol Genel Müdürlüğü'nün 10.04.2000 tarih ve İ.A.H.-VET-İLAÇ/08998 sayılı emirleri ile veteriner müstahzarlarının kalite kontrolü için görevlendirilmiş referans laboratuvardır.

Laboratuvar, ruhsata esas ve saha denetimi gerçekleştirilecek veteriner müstahzarlarının kalite kontrolü amacıyla, etkin madde miktarlarının ve fiziksel özelliklerinin analizlerini gerçekleştirir. Teknik yeterliliğinin, doğru ve güvenilir sonuçlar üretme kabiliyetinin bir göstergesi olarak, Türk Akreditasyon Kurumu'ndan (TÜRKAK) akreditedir. Akredite olduğu konularda yeterlilik ve karşılaştırma testleri düzenler ve düzenlenenlere katılır.

Veteriner Tıbbi Ürünler Komisyonu'na üye personeli, ilaç ruhsat dosyalarını inceler. Laboratuvar,  ilaç varyasyon dosyalarını incelemekle görevli yegâne birimdir.  Laboratuvar personeli, veteriner ilaç üretim tesislerinin GMP denetimlerine denetçi olarak iştirak eder.

Laboratuvar, üretici firmaların talep ettikleri ilaç analizlerini gerçekleştirdiği gibi, Tarım ve Orman İl Müdürlükleri tarafından gönderilen ve sorun oluşturduğu bildirilen veya yargıya intikal etmiş ihtilaflı ilaçların analizlerini yapmakla yükümlüdür.

Bilimsel çalışmalara katılmak, sürekli eğitimle gelişmek ve deneyimlerini paylaşmak laboratuvarın önemli görevlerindendir.